组织现在共有一首领，一副首领，四护法。分殿共四殿：丰缘分部琉璃殿，护法末；橘子群岛分部修罗殿，护法修；合众分部桐馆，护法桐；和城都分部冥殿，护法冥。
大会结束后，小瞬化名森景继续踏上旅程；天桐在这之后于枯叶市定居，没有任何消息；莉拉回了对战塔，当回对战大君，当然某首领也跟了过去。
小刚在组织大会结束后还是继续进修神奇宝贝医生。
小智和小霞吗？
小霞回了华蓝道馆，当回了道馆训练家，每天都有许多挑战者；小智则在家待着了，有的时候去一趟大木研究所后院，但被他那群还没消气的神奇宝贝们给轰了出去。
皮卡丘对此摊手，无奈。
小智有时候也会溜去华蓝道馆，他每天还要处理联盟事务已经离不开关都地区了，有的时候去了一趟深山就是两三个星期。
一切都恢复了平静。
华蓝道馆：
“下一位挑战者。”小霞活动了一下脖子和四肢，收回了暴鲤龙。
回来四个月，没有人从她的手中拿走徽章。而小霞，已经两个月没见到她的男朋友了。
她其实也给他打过电话，却没人接。
他去哪了？
小霞从思绪里回过神，想起她还在进行道馆战，便抬起头看向对面的挑战者。
这一看，呆住了。
眼前的人，是一位她很熟悉的挑战者。
小霞摇了摇头，接着别过头去。她抬手揉了揉眉头，嘴唇紧紧抿着，她平复了一下心情，才回头说道：“挑战者，请报上你的名字。”
她的眼眶中布满红色。
挑战者的穿着十分少年，肩膀上站着一只笑眯眯的黄色的肥耗子。
没错，是肥的。
“我是来自真新镇的小智，这是我的搭档，皮卡丘。”挑战者一脸幸灾乐祸，和肩膀上的肥耗子对视后笑嘻嘻地说道，“我回来啦！”
☆、挑战者【番外】
番外：挑战者
孤影团飞船事件过去已经一年，所有人的生活逐渐回到正常的轨道上。
孤影团在这一年里沉寂了下来，没有在任何地区出现过。这让组织的大家慢慢放松了警戒。
最近一年举行的华丽大型庆典中，新秀神奇宝贝协调训练家森景一举夺冠，获得缎带奖杯后进军神奇宝贝华丽大赛冠军大赛。
而新一届的关都联盟在石英高原准备举行。
小智作为关都冠军，自然要出席关都联盟。
石英高原。这个地方被许多神奇宝贝训练家称为梦想开始的地方。
小智带着皮卡丘在大赛会场和工作人员对接明天的开幕仪式的流程。
“然后就是四天王的小霞小姐与您的开幕示范赛。”工作人员把笔挪到纸的下方，“小智先生，小霞小姐好像还没到石英高原。”
小智摆摆手：“没事儿，我待会儿问问她在哪，过去接她就行了。”
“好的，那明天的开幕式大概就是这些流程了。”工作人员朝小智微鞠一躬，便离开了。
小智朝工作人员挥了挥手，随后给皮卡丘准备了食物：“待会儿吃完，我们去接她。”
皮卡丘点点头，快速低下头扒拉食物。
―
小智带着皮卡丘，骑着喷火龙往华蓝市的方向飞着，同时用组织的通讯器联系小霞，却没有人接听。他打到华蓝道馆去，菖蒲却说小霞两天前就出发石英高原了。
“奇怪，是出事了吗......”小智有些担心，拍拍喷火龙，“喷火龙，飞快点。”
小智将电话打回大木研究所，请小茂派出他留在研究所的飞行系神奇宝贝们出发，在真新镇到华蓝市附近寻找小霞的踪影。神奇宝贝们常年住在真新镇，偶尔跑出去玩，早就把关都地区的地形摸的一清二楚了。
猫头夜鹰带着飞行队伍的神奇宝贝们从大木研究所后院飞出，分散开来寻找。修罗殿和组织总部的暗影均出发寻找末护法。
一直到傍晚六点，依旧没有小霞的消息。
小智在关都地区飞了一圈，比雕和喷火龙轮流载着他飞都找不到小霞的影子，他没办法只能回到石英高原。
小霞是组织的护法，她如果想藏起来，就算组织把关都地区翻了个底朝天，都不一定找得到人。小智换位思考之后，原本悬在嗓子眼里的心瞬间放下了。
她没事，只是暂时藏起来了。
就像一年前，他故意藏起来两三个月，最后和皮卡丘一起去华蓝道馆挑战她一样。
真记仇。
―
第二天早晨，小智按时参加关都联盟的开幕式，跟着大队伍一起顺利把流程走了下来。
一直到关都联盟的开幕示范赛。
由于四天王小霞一直找不到人，联盟方面本来想要叫小茂过来救场，但小智拒绝了。
“放心吧，小霞会来的。”
联盟工作人员实在没办法，只能相信小智的判断了。
小智在石英高原运动场上站着，肩膀上坐着的是皮卡丘。他的目光一直看着对面的入口。
她会来的。
“那个，本次关都联盟的开幕示范赛......”
“不是开幕示范赛喔。”
主持人见会场的气氛很微妙，便开口想要缓解尴尬，却被一道女声打断了。
“是关都四天王小霞，挑战关都冠军小智的冠军挑战赛。”
小智对面的入口处终于有了一道身影。
皮卡丘侧头和小智说话，却发现小智的眼里跳跃着兴奋的光芒。那是他和强的对手交手之前，一定会有的光芒。
皮卡丘还记得以前，他与真司之间的一场场比赛。小智输了，就一定会下定决心，下一次要打败真司。
小智现在就是那样的眼神。
坚定，兴奋，和强者比赛的心情。
会场的大荧幕从一个神奇宝贝的空格，变成了冠军挑战赛的6v6。对战场地也由空地变成了水的场地。
对面入口走进来的女孩有一头橘色的头发，齐耳的短发，在左边绑了一小揪马尾。黄色的短t恤连着红色的绑带，与下身的牛仔短裤连在一起。她背着一个橘红色的背包，脚边跟着一只小皮卡丘。
是四年前，他们刚刚结伴旅行时的模样。唯一有些不一样的就是，她变得更加成熟，身材也更高挑了。
小智仿佛猜到了什么，他摸了摸皮卡丘的头：“准备一下，你最后一个上场哦。”
他可没忘记，小霞拥有克制皮卡丘最好的对手――萌萌哒的小神奇宝贝。她今天带着小皮卡丘来，应该是针对皮卡丘的。
“主持人，可以开始比赛了吧。”小霞从背包里拿出神奇宝贝球。
“啊，对。由关都四天王小霞小姐挑战关都冠军小智先生的冠军挑战赛现在开始，可使用的神奇宝贝为六只，当一方所有的神奇宝贝失去战斗能力，则比赛结束。比赛中，只有四天王具有交换神奇宝贝的资格。”主持人将刚刚接到的信息念出，“那么现在，挑战赛开始！”
“我的第一只神奇宝贝！去吧！宝石海星！”
小智拿出宝贝球：“妙蛙种子，就决定是你了！”
番外：完。