皮卡丘按照之前小智跟它拟订的暗号，朝空中发出了一道电球绝招。
电球绝招发出后，小智明白了意思后，再次吩咐：“皮卡丘，等那头传来消息你和雷丘再动手。”说完他切换无线电对暗影们下令，变声道：“所有人，动手。”
暗藏在峡谷里的暗影同时蜂拥而出，将孤影团把守在正南入口的兵力打散，还有一部分的暗影往谷内冲去，寻找飞船。小智自然也从暗处现身，还没动身去找，月祁的一脚就上来了。
皮卡丘在等小霞和小瞬的无线电。
小霞和小瞬带着人各自到了指定地点。
“我到了。”
“我也是。”
皮卡丘应了声，随后招呼着雷丘准备行动。
峡谷峡谷，正是中间峡谷两边高墙。皮卡丘站在东侧高墙的最高点，雷丘在西边的最高点。两只同时发力，惊人的雷电迸出，瞬间将把守东西两边入口的孤影团成员电到昏厥。
这样强大的雷电自然吸引了许多人的目光。
月祁后知后觉，这才明白他中了调虎离山。修罗殿队的大摇大摆以及修护法的带队，还有东西两处入口毫无动静，都让他以为组织再无援手来到，但实则却是修护法拖住他，东西的兵力减少一半来到正南入口。
好一个修护法！
“灰一！”月祁朝暗处喊道。
暗杀队队长现身。
小智挑挑眉，然后挥出宝贝球：“烈焰猴！赫拉克罗斯！”
烈焰猴登场就朝灰一挥出拳，绊住他往东入口的脚步。而赫拉克罗斯则是接替小智与月祁争斗。
小霞和小瞬在把守人员皆昏厥后带人入谷，按照之前说的计划，小瞬拖住所有前来迎击的孤影团成员，掩护小霞寻找飞船。
小智见月祁已被拖住，闪身离开此处，往谷内深入而去：“找到飞船了吗？”他切换小霞频道的无线电。
小霞带着哈克龙快速往谷内深处奔去，四处寻找着，但一直没看见飞船的影子：“没有，是不是月祁转移地方了？”
小智想了想，切换皮卡丘频道：“皮卡丘，你和雷丘在高处找一下飞船。”
接到命令的皮卡丘停下放电，朝雷丘招招手说明命令后，两只同时撒腿往不同方向使用电光一闪探查。
为啥不用飞行神奇宝贝。
小智无奈，他这次没带飞行系的神奇宝贝在身上。
“皮卡！”
小智停下步伐，发现皮卡丘和雷丘同时从两边高墙奔跑而下，皮卡丘照例爬上小智的肩膀，雷丘站在小智的脚边。
“找到了？”
雷丘和皮卡丘同时点头，指了一个方向。
小智切换回小霞频道的无线电：“末，你跟哈克龙往南边入口找，我过去跟你汇合。”
“好。”
皮卡丘靠手舞足蹈来描述它怎么找到的飞船，小智身为多年搭档也看懂了。
地下。
谁能想象在卡洛斯峡谷的地底下，有一个巨大的洞窟放着飞船。孤影团也不知道填坑，皮卡丘和雷丘在第一次寻找无果后同时寻找，最后发现了一个重兵把守的大洞。那洞旁全部都是强大的神奇宝贝在把守着，怪不得守入口的只有人而已。
小智和小霞汇合之后，放出两人身上所有的神奇宝贝。
皮卡丘、雷丘、天蝎王、小锯鳄、哈克龙、太阳珊瑚、小皮卡丘、帝王拿波。
“修，走吧。”
两人根本不在意把守的神奇宝贝多强，多厉害甚至是哪只神奇宝贝的进化型。他们的任务是阻止飞船启动，完成联盟的任务，无论对手多强，打败就是了！
小瞬接到智霞二人去飞船那里的消息时，就决定去寻找月祁，死死拖住他。
月祁这会儿早就摆脱赫拉克罗斯，却不想被迎面而来的小瞬踢了一脚，又被缠住了。
月祁早有耳闻，组织有一位待转正的护法还在渊谷训练，眼前的黑衣斗篷人不如桐护法身形高挑，修护法他方才见过，而末护法是女生，所以。这身形与他差不多高且气息冷冽的黑衣人，应该是那位待转正的护法，冥。
“冥护法是吗，咱们来过过招！”月祁对方才踢出这一脚的小瞬产生了浓厚的兴趣，快速上前挥出拳。
小瞬自然不会放过和高手过招的机会，上前迎击。
话转小智和小霞。
皮卡丘和雷丘带路来到那个大洞时，就被守在大洞旁的神奇宝贝盯上了。
领头的是一只班吉拉，无论在哪班吉拉对于神奇宝贝训练家们都是致命的恐惧。因为它太强了。
班吉拉身后还有冻原熊，鸭嘴焰龙，黑鲁加，蟾蜍王，蜈蚣王类似这种体型巨大且实力很强的神奇宝贝。
神奇宝贝之间就该由神奇宝贝去对战，小智和小霞对视之后，默契地退到一旁观战。
在皮卡丘的指令下，八只神奇宝贝散开阵型，哈克龙飞空。由天蝎王和帝王拿波站在最前方并肩，二只中间是雷丘，太阳珊瑚和小锯鳄在炒炒猪和帝王拿波身后，因为两只的身影高大因而正前方根本看不见太阳珊瑚和小锯鳄。皮卡丘带着小皮卡丘在阵型最后方。
战斗一触即发。
班吉拉掀起了沙雹，所有神奇宝贝都被卷入沙雹之中，只有哈克龙因为升空而得以脱身。哈克龙颈前的珠子亮起，天空乌云密布，紧接着下起了雨。帝王拿波、小锯鳄和太阳珊瑚因为雨的加成，攻击力与行动将更加迅速了。
雷丘见下起了雨，沙雹的威力有所减弱，在天蝎王的帮助下被扔上高空，同时皮卡丘，小皮卡丘由破开沙雹的哈克龙载着升空，天蝎王在扔完雷丘之后带着小锯鳄和太阳珊瑚乘着沙雹的风飞起。
哈克龙载着的皮卡丘和小皮卡丘升空到和雷丘一般高度后原地跃起。
由班吉拉身后射来的种种远程攻击被哈克龙和天蝎王敏捷地躲开。
雷丘凝聚起力量，一发惊人威力的打雷落在敌方所有神奇宝贝的身上。水导电，除了班吉拉这类型的地面系免疫电的神奇宝贝在打雷后还能站着，其他的已经倒地不起了。
小皮卡丘坐在哈克龙的尾巴上鼓掌。
乌云散去，雨也停了。现在对方神奇宝贝只剩下班吉拉、隆隆岩、庞岩怪三位。
由于水导电的关系，三位地面系或者岩石系的神奇宝贝多多少少都受伤了。
八只神奇宝贝重新落地，皮卡丘和小皮卡丘以及雷丘自动退后到主人身边。剩下的就交给前边那几位了。
隆隆岩往前滚动，庞岩怪使出了电光炮泽，班吉拉使出了地震绝招。
小锯鳄和太阳珊瑚原地跳起，一同使出水炮绝招阻拦隆隆岩的滚动；天蝎王乘风而起，飞到高处后，身前出现了一道光幕，使出了超级冲击飞向庞岩怪；帝王拿波先是使出了回转攻让自己飞起躲开地震绝招带来的伤害，随后使出了水电炮袭向班吉拉；哈克龙在空中使出水炮绝招与小锯鳄太阳珊瑚一起阻挡隆隆岩，并且让二只坐在自己身上。
隆隆岩最后还是因为三道水炮威力过大而停下，最后再次被三发水炮打到失去战斗能力。
班吉拉被水电炮命中后使出了破坏死光打向帝王拿波，帝王拿波再次以水电炮回击，哈克龙以水炮辅助。
庞岩怪这里被超级冲击命中后正为打不到飞回高空的天蝎王恼怒，使出岩石封闭飞向帝王拿波。
一旁的太阳珊瑚和小锯鳄见状连忙出手阻止岩石封闭的岩石，但两发水炮还是无法阻挡所有飞往帝王拿波的岩石。就在岩石即将打中帝王拿波时，一道刀叶将所有的岩石粉碎了干净。
“皮卡皮卡！”皮卡丘挥舞着双手。
蜥蜴王带着组织的速度部队提前到达了卡洛斯峡谷按照原计划和小智小霞汇合完毕；喷火龙带着飞行部队在空中随时支援。
现在的卡洛斯峡谷，空中已经完全被组织凡是可以飞的神奇宝贝占领，此景盛大。
有了蜥蜴王的加入，庞岩怪被蜥蜴王和藤藤蛇的双重叶暴风打败后失去战斗能力；班吉拉也在众多水系草系的神奇宝贝们面前败下阵来。
解决了大洞口的守卫神奇宝贝，小智让速度部队在洞口守着，让喷火龙去协助谷内正在和月祁战斗的小瞬后，和小霞一起带着皮卡丘和小皮卡丘进入洞中。
洞口很大，但进洞的路只有一条。
二人拿着手电筒往前走，一路上并没有任何的危险与陷阱。